Talvolta capita che le immagini acquisite presentino dello sporco costituito da punti neri isolati, dovuti a polvere depositata sui sensori di acquisizione o addirittura a interferenze elettrostatiche dovute a surriscaldamento dei componenti elettronici. Il termine anglosassone utilizzato per identificare questa tipologia di sporco è la parola speckle, e l'operazione di pulizia per l'identificazione e la rimozione di questi punti è definita despeckle. I tool software che effettuano questo tipo di elaborazione non necessitano di intervento umano, sono estremamente veloci e possono lavorare su immagini monocromatiche, in scala di grigio o a colori. Quelli più efficaci possono implementare degli algoritmi avanzati tali che pur eliminando elementi di sporco molto grandi evitano che segni di punteggiatura o punti sulle "i" possano essere rimossi in modo accidentale.

Non tutti i documenti cartacei sono scritti in modalità "portrait", ossia, pensando ad un foglio A4, con l'orientamento naturale per la lettura tale che la parte stretta sia la base del foglio. Talvolta capita che grafici, tabelle, schede ed elaborati simili siano stampati in modalità "landscape", ossia, riferendoci sempre ad un foglio A4, con la parte larga come base del foglio. Quando si effettua la scansione di documenti, si usa sempre il medesimo orientamento per cui ci si troverà con immagini correttamente ruotate per la lettura e con altre no. Per evitare che, durante la successiva consultazione dei documenti, l'operatore debba ripetutamente usare funzioni di rotazione per poter leggere correttamente a schermo il documento, sono state sviluppate apposite funzioni di auto orientamento che consentono di effettuare automaticamente tale operazione in batch, su un gruppo di documenti, senza intervento umano. Tali tools consentono quindi di individuare il corretto orientamento di lettura e di decidere autonomamente se il documento è dritto o se ruotare automaticamente le immagini di 90, 270 o 180 gradi.